Uroczystości pogrzebowe rozpoczęła w sobotę 26 stycznia Msza św. w stołecznym kościele sióstr wizytek na Krakowskim Przedmieściu. Przewodniczył jej bp Tadeusz Pikus. „Ksiądz Prymas czasami był stanowczy, ale nigdy nie walczył przeciwko komukolwiek czy czemukolwiek. Nie walczył przeciwko człowiekowi czy przeciwko światu, lecz walczył o człowieka i o świat. Szedł jak owca między wilki, był roztropny jak wąż i nieskazitelny jak gołąb”- mówił bp Pikus.
Kościół szczelnie wypełnili warszawiacy, siostry zakonne i klerycy z trzech seminariów duchownych.
Po południu przy trumnie kardynała Glempa modlili się grekokatolicy. Liturgii żałobnej odprawianej w rycie wschodnim przewodniczył biskup wrocławsko-gdański Włodzimierz Juszczak. Przypomniał, że to Prymas Glemp rozpoczął dialog i pojednanie polsko-ukraińskie: w roku 1987 z kardynałem Lubacziwskym (UKGK) wymienił deklaracje o wzajemnym przebaczeniu.
Przez całą sobotę, stojąc w długiej kolejce przy kilkunastostopniowym mrozie, mieszkańcy stolicy oddawali Prymasowi hołd i żegnali go. Świątynia była otwarta tak długo, jak długo przybywali ludzie chcący pożegnać Kardynała.
We Mszy Świętej uczestniczył również biskup kaliski Stanisław Napierała i biskup witebski Władysław Blin pochodzący z okolic Konina.